Ce cours abordera les différentes techniques d’analyse
biologique qui génèrent des données à haut débit (techniques dites
”omics”), telles que: séquençage de l’ADN et de l’ARN, protéomique,
métabolomique... (liste non exhaustive qui sera adaptée en fonction de
l’évolution rapide de ce domaine).
Pour chaque méthode, le cours introduira :
- Le principe de fonctionnement de chaque méthode (séquençage, spectrométrie de masse, etc)
- L’analyse, le traitement et la normalisation des données brutes
- L’interprétation et la visualisation des données.
- Les biais et pièges liés à ces techniques (problèmes de variabilité technique et biologique, reproductibilité, design expérimental).
Les méthodes génériques d’analyse des données biologiques seront
également abordées (clustering, enrichissement, ontologies...), en lien
avec le cours d’analyse de données et les cours de statistiques.
Enfin, le cours inclura une introduction aux banques de données exploitables dans ce domaine (TCGA, GEO, Encode etc).
- Enseignant: Branders Vincent