Les enseignants

  • Xavier Draye
  • Laura Symul
  • Nicolas Biot (assistant)

Contenu 

Ce cours aborde les méthodes de planification expérimentale utilisées dans le domaine des essais agronomiques (e.g., plans en blocs aléatoires, split-plot, plans en lignes et colonnes, alpha design) ainsi que les modèles d’analyse statistique correspondants (modèles linéaires mixtes). Les méthodologies et les outils sont présentés de façon intuitive sur base d'études de cas issus de l’expérimentation animale (e.g., données longitudinales) et végétale (e.g.., essais au champ) et du phénotypage (e.g. essais variétaux). En fin de cours, trois cours sont consacré au plans d'expérience multi-facteurs en recherche en laboratoire ou industrielle. 

Modèles à composantes de variances
  • Analyse de la variance à un facteur aléatoire
  • Estimation d'effets aléatoires et de composantes de variance
Modèles linéaires mixtes
  • Formulation des effets aléatoires <> structure de la matrice de covariance
  • Analyse de modèles mixtes typiques en biologie (génétique, plans expérimentaux)
  • Analyse des données longitudinales (répétées)
  • Analyse de la covariance en modèles mixtes 
     
Planification expérimentale 
  • Stratégies expérimentales en agronomie 
  • Description d'un problème et évaluation de la qualité d'un plan 
  • Puissance, choix du nombre d'essais et plans expérimentaux
  • Principe de blocking
  • Block designs (complete and incomplete) 
  • Row-column designs 
  • Design multifacteurs :  plan factoriels complets et fractionnaires, plans pour l'estimation de modèles d'ordre 2

Evaluation

L'évaluation est basée sur un examen en salle info composé de :

  • Une partie sur R concernera la programmation d'un RMarkDown contenant une modélisation et de la génération de plans
  • Une partie écrite comprendra des exercices de choix de plans et d'interprétation des résultats de R. 
  • Matériel disponible
    • Un formulaire R fourni pour le cours
    • Un script R de base à préparer par vous. Nombre maximum 300 lignes de code. Vous pouvez uniquement mettre des titres et du code mais pas d'interprétation.  
    • 1 page recto verso de notes manuscrites.   
    • Le recueil de formules fourni sur Moodle. 
Travaux pratiques 

Chaque séance de TP fonctionnera de la manière suivante : 

  • Introduction au TP et feedback sur le TP précédant
  • Travail sur un fichier RMarkDown vide à remplir et à rendre sous forme de devoir pour la fin du TP (au plus tard le jour même à 23h59)
  • Correction de son travail à l'aide du fichier de correction de l'assistant et remplissage d'un formulaire Moodle pour la fin de la même semaine.
Les travaux pratiques seront évalués lors de l'examen en salle info.  Les travaux à réaliser en parallèle aux TPs sont obligatoires. Tout étudiant qui n'a pas remis 80% des travaux sera pénalisé à l'examen (voir détails sur moodle).   

Última modificación: jueves, 25 de enero de 2024, 12:30