Ce cours présente les différentes techniques mises en œuvre pour établir le diagnostic des causes biotiques des maladies et caractériser les agents infectieux. Les différentes méthodes d’analyses sont exposées sur base d’une approche problème en santé végétale: microscopies (optique, à fluorescence, confocale, électronique), sérologie (méthode immuno-enzymatique ELISA,), biologie moléculaire (PCR, RT-PCR, PCR quantitative, northern blot, western blot   microscopiques), séquençage (par hybridation, haut débit), …